מכיוון שמרכז פראג קומפקטי, הגיוני ללון קרוב אליו, ליד המסעדות, החנויות והאתרים המרכזיים. מלונות רבים נמצאים סביב כיכר ואצלב (Václavské náměstí). שם נמצאים בלב העניינים, ורוב המלונות – אם כי לא כולם – קובעים את מחיריהם בהתאם. אזור פופולרי נוסף בקרבת מקום הוא Náměstí Republiky, אבל המיקום המבוקש ביותר הוא סביב כיכר העיר העתיקה (Staroměstské náměstí), במרחק הליכה קצר מגשר קארל. המלונות שם נעים בין רשתות בינלאומיות גדולות לבתים צ’כיים מסורתיים וכמה מלונות קטנים ויוקרתיים מאוד. דרומה יותר, בעיר החדשה (Nové Město), יש כמה מלונות זולים יותר, במרחק כמה תחנות מטרו בלבד מכיכר העיר העתיקה. עם זאת, האזור הזה פחות יפה, ובחלק מהרחובות יש תנועה כבדה.
לנוף אל הוולטאבה, כדאי לבדוק את המלונות שעל הנהר ליד הרובע היהודי (Josefov), אבל רבים מהם מודרניים ויקרים. כמה בוטלים (מלונות צפים) עוגנים לאורך הסוללות, מעט הרחק מהמרכז. רבים מהם שופצו, ולמי שלא אכפת לו מעט פחות מקום, הם אפשרות יוצאת דופן ששווה לשקול בתקציב מוגבל.
מעבר לגשר קארל, בעיר הקטנה (Malá Strana), יש כמה מלונות מקסימים בסביבה יפה, ומעטים יותר ליד טירת פראג ב-Hradčany. צפונה יותר וברובעים החיצוניים יש מלונות גדולים ופשוטים למדי ורבים שאינם מיוחדים.
הם מציעים בדרך כלל מתקנים מספקים, אבל יכולים לעלות כמעט כמו מלונות במרכז, בתוספת הזמן והעלות של הנסיעה לעיר. המטרו פועל מבערך 5 בבוקר ועד חצות; אחר כך תלויים בחשמליות ובאוטובוסי לילה או במונית. למידע נוסף על הרובעים השונים, ראו איפה ללון בפראג.