Eftersom Prags centrum är kompakt är det klokt att bo nära det, i närheten av de viktigaste restaurangerna, butikerna och sevärdheterna. Många hotell ligger runt Wenceslastorget (Václavské náměstí). Där är du mitt i smeten, och de flesta hotell – men inte alla – sätter sina priser därefter. Ett annat populärt område i närheten är Náměstí Republiky, men det mest eftertraktade läget är runt Gamla stans torg (Staroměstské náměstí), en kort promenad från Karlsbron. Hotellen där sträcker sig från stora internationella kedjor till traditionella tjeckiska hus och några små, mycket exklusiva hotell. Längre söderut, i Nya stan (Nové Město), finns några billigare hotell bara några tunnelbanestationer från Gamla stans torg. Det här området är dock inte lika vackert, och vissa gator har tung trafik.
Vill du ha utsikt över Moldau kan du titta på hotellen längs floden nära det judiska kvarteret (Josefov), men många av dem är moderna och dyra. Flera båthotell (flytande hotell) ligger förtöjda längs kajerna en bit från centrum. Många har renoverats, och om du inte har något emot mindre utrymme är de ett ovanligt alternativ som är värt att överväga om du har en begränsad budget.
På andra sidan Karlsbron, i Lillsidan (Malá Strana), hittar du några charmiga hotell i vacker miljö, och färre nära Pragborgen i Hradčany. Längre norrut och i ytterstadsdelarna finns stora, ganska anonyma hotell och många mer alldagliga.
De har oftast tillräckliga faciliteter, men de kan kosta nästan lika mycket som hotell i centrum, och dessutom tillkommer tid och kostnad för att ta sig in till stan. Tunnelbanan går från ungefär 05:00 till midnatt; därefter är du hänvisad till nattspårvagnar och nattbussar eller taxi. För mer om de enskilda stadsdelarna, se Var du ska bo i Prag.